Като част от инициативите по отбелязване на 30-годишнината от създаването на Националната агенция за оценяване и акредитация (НАОА), действащият председател на Агенцията – проф. д-р Елиза Стефанова, в присъствието на членовете на Акредитационния съвет на НАОА, връчи почетен плакет на проф. дтн Христо Христов, 
назначен за изпълнителен директор на НАОА в периода 1996 г.-2000 г.
Първият председател на Агенцията през този период е проф. д-р Димитър Бучков, чл.-кор. на БАН и бивш ректор на Технически университет – София. В изпълнение на Закона за висшето образование (ЗВО) и приетия Правилник за дейността на НАОА, първият Акредитационен съвет започва работа в края на 1996 г., без да има собствен опит в областта на оценяването и акредитацията на висшето образование.
Проф. Христов разказа за първите стъпки на агенцията през този начален период от нейното съществуване и основните предизвикателства, които са стояли пред управителните органи по това време. От една страна основна задача е била осигуряване на материалната база на Агенцията и формирането на вътрешната ѝ структура, а от друга – изготвянето на нормативната база, включваща критериите, методите и процедурите за оценяване и свързаните с тях нормативни документи. В стремежа си да бъде открита най-подходящата за българските условия система, е бил възприет като основен подходът за проучване на чуждестранния опит, 
на най-добрите практики от него и адаптирането им към спецификата, състоянието и традициите на българското висше образование. Важен фактор за изграждането на НАОА и разработването на нейната документация е било участието на Агенцията в проект по програма PHARE – една от трите програми за подпомагане на присъединяването на България към ЕС.
През първите си години НАОА активно е работила в посока на провеждане на информационни кампании чрез издаване на бюлетини и приложения с публикуване на годишни отчети и решения на Акредитационния съвет, провеждане на редица обучения с номинирани от висшите училища кандидати за експерти, които да участват в процедурите по оценяване. Първите процедури за институционална и програмна акредитация са били проведени през 1998 г.